4．2．7．7 禁止为了提高畜禽群体的生产力而使用抗生索、抗球虫药和其他生长促进剂，禁止使用激素控制畜禽的生殖行为(例如诱导发情，同期发情、超数排卵)。但激素可在兽医监督下用于对个别动物进行疾病治疗。
4．2．8 非治疗性手
4．2．8．1 允许采用以下非治疗性手术，但应尽量减少给动物带来的痛苦，必要时可使用麻醉剂：
a．为了保持产品质量和传统生产习惯而进行的阉割(肉猪、牛、鸡)；
b．断角；
c．为了防止蝇蛆病而进行的羔羊断尾；
d．剪羽。
4．2．8．2 禁止进行以下非治疗性手术；
a．断尾(除羔羊外)；
b．剪喙；
c．烧翅；
d．其他没有明确允许的非治疗性手术。
4．2．9．繁殖
4．2．9．1 提倡自然繁殖。
4．2．9．2 允许采用不对畜禽的遗传多样性产生严重限制的各种繁殖方法。
4．2．9．3 禁止使用胚胎移植技术。
4．2．10 运输和屠宰
4．2．10．1 屠宰的有机畜禽必须来自有机养殖场。
4．2．10．2 畜禽在装卸、运输、待宰和屠宰期间必须有专人负责照料，并使动物遭受的胁迫和痛苦降低降到最低限度。
4．2．10．3 市禽在运输过程中必须清楚地标记。
4．2．10．4 当用车辆运输时，运到屠宰场的时间不应超过8小时，根据具体情况可有例外。在例外的情况下，必须给畜禽喂食、喂水。
4．2．10．5 禁止使用电棒及类似设备驱赶动物。禁止在运输前和运输过程中，对动物使用镇静剂或兴奋剂。
4．2．10．6 必须在国家卫生防疫部门批准的屠宰场宰杀畜禽。
4．2．10．7 禁止在帝禽失去知觉之前，就进行捆绑、悬吊和屠宰。
4．2．10．8 有机畜禽和常规畜禽应分别屠宰，屠宰后应分别存放并清楚标记。
4．2．11 奶制品
奶制品生产除满足4．2．1～4．2．10的畜禽养殖标准外，还必须满足以下要求：
4．2．11．1 允许使用附录E中物质对奶制品加工设备进行清洗和消毒，并标则其用途和正确的使用方法。所有使用过清洁剂的设施必须得到彻底的清洗，以保证在设备和奶制品中没有清洁剂残留。
4．2．11．2 有机牛奶至少必须符合常规牛奶的卫生要求及质量标准。建议牛奶中年均体细胞数不能超过400 000个／m1 (800 000绵羊或山羊)；细菌数最大不得超过10 000个／ml。建议每月分析一次每头奶牛产奶中的体细胞含量。如果没有达到这些质量标准，则要求制定满足这些标准的计划，并提交有机食品认证机构枇准。对新的畜群，在认证前3个月，奶汁中平均体细胞数就应低于400 000个／ml(800 000绵羊或山羊)．
4．2．11．3 奶牛饮用水必须符合国家有关标准。
4．2．12 禽蛋生产
蛋类生产除满足4．2．1～4．2．10的畜禽养殖标准外，还必须满足以下要求：
4．2．12．1 母鸡在鸡舍中的平均活动空间至少需要0.2m2／只。
4．2．12．2 必须具备适宜季节里的室外活动场所。
4．2．12．3 必须每天喂营养平衡的日粮以确保满足其营养需求。
